De Minñur sufrió la lesión al final de su victoria en cuarta ronda contra el francés Arthur Fils por 6-2, 6-4, 4-6 y 6-3 el lunes.
El jugador de 25 años había alcanzado previamente dos cuartos de final de Grand Slam, perdiendo ante Dominic Thiem en el US Open 2020 y Alexander Zverev en el Abierto de Francia este año.
"Estoy devastado por retirarme debido a una lesión en la cadera, un pequeño desgarro del cartílago de fibra que está al final o se conecta con el aductor", dijo De Miñaur, quien sorprendió a Djokovic en el torneo por equipos United Cup en la semana de apertura de la temporada.
"Sentí un fuerte crujido durante los tres últimos puntos de mi partido contra Fils y ayer me hicieron un escáner que confirmó que esa era la lesión y con alto riesgo de empeorar si pisaba la pista.
"Conocía los resultados (del escáner) de ayer, pero esperaba despertarme hoy y sentir algún tipo de milagro. El problema de que salga a jugar es que un estirón, un resbalón, cualquier cosa puede hacer que esta lesión pase de tres o seis semanas a cuatro meses".
El australiano se encuentra ahora en una carrera por estar en forma para los Juegos Olímpicos, donde el tenis comienza en Roland Garros el 27 de julio.
La retirada de De Minaur supuso que Djokovic, siete veces campeón, igualara el récord de Roger Federer de 13 participaciones en las semifinales de Wimbledon.
Djokovic, de 37 años, se enfrentará al estadounidense Taylor Fritz o al 25º cabeza de serie, Lorenzo Musetti, que se enfrentarán más tarde.